Pour la première fois, les 16 trésors nationaux conservés par le musée seront exposés afin d'aider les visiteurs à mieux comprendre leur valeur historique et culturelle.

Il s’agit d’abord d’un tambour de bronze Ngoc Lu de la culture Dong Son, datant d'environ 2.000 à 2.500 ans, qui est le plus beau et le mieux conservé de tous les tambours découverts jusqu'à présent. Il a été nommé trésor national en 2012.

Autre objet exposé, un tambour de bronze Hoang Ha, également de la culture Dong Son, qui a été trouvé dans le hameau de Noi Thon, village de Hoang Ha, district de Phu Xuyen, province de Ha Son Binh (aujourd’hui Ha Noi). Ce tambour est relativement intact avec des motifs décoratifs uniques et est regroupé dans la même catégorie avec des tambours de bronze Ngoc Lu.

Parmi les autres trésors nationaux, on peut citer le pot de terre cuite glacée Dao Thinh, une statue représentant deux hommes jouant de la flûte de Pan, une lampe en forme de personne agenouillée, une​ tombe en forme de bateau, la stèle Vo Canh et la cloche de la pagode Van Ban.

Le musée conserve près de 200.000 documents originaux et des objets d'importance historique, culturelle et scientifique.